يقوم الباحثون بتحويل مشاكل البيانات الضخمة إلى اكتشافات بحثية بيولوجية وأدوية مذهلة

تعمل جامعة إلينوي في شيكاغو ومركز التحليل الجينومي في نورويتش بالمملكة المتحدة على تسريع اكتشاف الأدوية وتحليل المشكلات المعقدة باستخدام أجهزة كمبيوتر SGI HPC

يعمل الباحثون في مركز التكنولوجيا الحيوية الطبية في UIC على تطوير علاجات جديدة تستهدف الأمراض المعدية، بمساعدة أجهزة الكمبيوتر HPC (أجهزة الكمبيوتر عالية الأداء) أو ما كان يسمى حتى وقت قريب أجهزة الكمبيوتر العملاقة، من شركة SGI.

يعد اكتشاف المكونات الكيميائية المبتكرة التي تشكل الأساس لتطوير الهياكل الجزيئية لمضادات الميكروبات الجديدة مهمة شاقة.

"يستخدم الباحثون في المركز مجموعات قائمة على نظام التشغيل SGI IRIX OS على مدار العقد الماضي، وقد انتقلوا الآن إلى حل حوسبة عالي الأداء من SGI UV مدعوم بمصفوفات كبيرة من معالجات Intel Xeon ووحدات معالجة الرسومات NVIDIA Tesla (GPUs). " قال مايكل جونسون، الأستاذ والمدير الفخري لمركز التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية في UIC. "توفر هذه المجموعات مرونة حوسبة في إدارة الحسابات التسلسلية والمتوازية، وقد أتاح لنا التوافق الأمامي لأنظمة SGI تطوير وتوسيع قدراتنا الحاسوبية بشفافية على مر السنين، ومواجهة التعقيد المتزايد للمشكلات التي نحتاج إلى معالجتها."

في المملكة المتحدة، يتخصص مركز التحليل الجيني (TGAC) في علم الجينوم والمعلوماتية الحيوية، مع التركيز على تحليل وتفسير الجينومات النباتية والحيوانية والميكروبية.

تم إطلاق فريق TGAC في عام 2009، وقد نما إلى أكثر من 50 عضوًا، حيث يعمل نصف موظفي المؤسسة بقدرات المعلوماتية الحيوية لتفسير وتجميع وتحليل مجموعات البيانات الناتجة عن التسلسلات المخزنة في مختبرهم.

ويوضح بول بارتار، مدير فريق الحوسبة العلمية في مركز التحليل الجيني: "الميزة الرئيسية لاستخدام مثل هذا النظام هي القدرة على تجميع وتحليل تسلسلات جينومية كبيرة ومعقدة للغاية، مع مليار تسلسل في الذاكرة".

يقول إسرائيل وينمان، مدير عمليات SGI في إسرائيل: "إن عائلة SGI UV سرعان ما أصبحت المعيار الفعلي للصناعة للعملاء الذين يواجهون بعضًا من تحديات البيانات الضخمة الأكثر تعقيدًا في العالم في علوم الحياة". "إن التنوع والمرونة وقابلية التوسع لنظام الأشعة فوق البنفسجية هو الذي جعل النظام حلاً مثاليًا للحوسبة والتخزين لهذه التحديات كثيفة البيانات."