قامت أنظمة POWER IBM بالتعاون مع تكنولوجيا شركة Mellanox الإسرائيلية بتفكيك جينوم بعوضة حمى النيل
استخدم فريق بحثي بقيادة علماء من مركز هندسة الجينوم في كلية الطب بجامعة بايلور تقنيات IBM، بالاشتراك مع أنظمة من شركة Melnox الإسرائيلية وشركة NVIDIA، من أجل فك تشفير تسلسل الجينوم البالغ عدده 1.2 مليار بعوضة Culex quinquefasciatus - التي تحمل وتنشر فيروس غرب النيل. إن فهم البنية الجينية قد يساعد في مكافحة الفيروس، من خلال تحديد نقاط الضعف في البنية الجينية للبعوض.
يعتمد نظام الحوسبة عالية الأداء (HPC)، الذي تم استخدامه لفك البنية الجينية للبعوض، على منصة IBM Power Systems التي توفر إمكانات معالجة قابلة للتطوير وقابلة للتطوير، والمطلوبة للتعامل مع مجموعة واسعة من الأبحاث القائمة على معالجة البيانات. أنشطة. وينضم النظام العامل في بايلور، والذي أطلق عليه اسم "VOLTRON"، إلى سلسلة طويلة من أجهزة الكمبيوتر العملاقة التي تصنعها شركة IBM والتي تم تركيبها في خدمة جهات مثل مختبر لورانس ليفرمور الوطني في الولايات المتحدة الأمريكية، ومركز هارتري العلمي البريطاني.
فولترون - كاسم بطل الكتاب الهزلي الذي يحمي العالم، يقدم القدرة على تجميع وتفسير الهياكل ثلاثية الأبعاد التي تسمح للعلماء بفك رموز طريقة تسلسل الجينات، من خلال اتباع أنماط الطي لسلسلة الحمض النووي ونقاط التقاطع في جزيئات مختلفة. تعتبر المنهجية التي تم تطويرها في بايلور بناءً على أنظمة IBM أسرع وأرخص من طرق التبليط السابقة. وهكذا، على سبيل المثال، في حين أن المشروع الأول لفك تشفير الجين البشري تطلب استثمارًا قدره 4 مليارات دولار، فإن طريقة التجميع ثلاثي الأبعاد تسمح بعرض تسلسل جينومي مماثل خلال أسابيع قليلة فقط، وباستثمار أقل من 10,000 آلاف دولار.
وفقًا لأولجا دودشينكو، زميلة ما بعد الدكتوراه في مركز الهندسة الجينية في كلية الطب بجامعة بايلور، فإن "التكنولوجيا تجعل من الممكن تغيير الطريقة التي نبني بها صورة مجموعة الجينوم. تم إنشاء VOLTRON في الأصل لفك تشفير تسلسل الجينوم البشري - وهي طريقة يمكن تطبيقها الآن على مجموعة مذهلة من الأنواع وأشكال الحياة. وهذا الاحتمال يوفر فرصة لدراسة البعوض الذي يحمل الأمراض التي تضر الإنسان في جميع أنحاء العالم".
يوضح إيريز ليبرمان أيدان، مدير مركز هندسة الجينوم، أن "التجميع ثلاثي الأبعاد وتكنولوجيا IBM يقدمان مزيجًا مذهلاً: يتطلب أحدهما قوة حاسوبية هائلة - يوفرها الآخر".
يعمل مركز هندسة الجينوم بالتعاون الوثيق مع شركة Mellanox الإسرائيلية، من أجل استخلاص أقصى قيمة من القدرات البحثية القائمة على نظام الحوسبة عالي الأداء VOLTRON. إن الاستفادة من تقنية الاتصالات الذكية الخاصة بميلانوكس، ومحركات تسريع الأداء، تتيح للمركز أن يقدم للباحثين منصة فعالة وقابلة للتطوير تعمل على تحسين قدرة التسلسل الجيني، من أجل إيجاد علاجات للأمراض التي تهدد الحياة.
إن مفتاح الإنجاز البحثي لجامعة بايلور هو أيضًا التعاون طويل الأمد بين IBM وNVIDIA، في تصميم أنظمة قادرة على الاستفادة من البنية المفتوحة لمعالجات POWER من أجل الاستفادة من قدرات المعالجة لمسرعات NVIDIA Tesla.
يجمع تصميم نظام VOLTRON بين تقنيات POWER وTesla بطريقة تتيح للباحثين التعامل مع كميات هائلة من البيانات، وبسرعة عالية للغاية. تم تصميم Voltron في تكوين مجموعة من أربعة أنظمة، يتضمن كل منها ثمانية مسرعات رسومات NVIDIA Tesla التي تم ضبطها خصيصًا لتقديم الأداء الأمثل في مهام البحث الجيني.
تعليقات 2
الأب، يبدو مثيرا للاهتمام!
وفي هذه الأثناء، قمت بتطوير طريقة لإبادة البعوض، أو على الأقل تقليل أعداده بطريقة كبيرة جدًا.
تعتمد طريقتي على جينات البعوض التي تجبر البعوض على وضع البيض في المياه الراكدة، ووقت وضع البيض حتى تفقس اليرقات حتى الوقت الذي تتحول فيه إلى الشرانق ثم إلى البعوض هو وقت طويل نسبيًا ويمكنك ذلك استخدم هذا الوقت لصب الماء مع اليرقات/البيض ومنع توليد البعوض التالي.
الطريقه بسيطه جدا.
قم بملء الحاويات بالمياه حول مكان إقامتك، والأهم من ذلك أنه لا بأس، اترك الحاويات مفتوحة حتى يأتي البعوض لوضع البيض فيها، وتأكد من إفراغها مرة واحدة على الأقل في الأسبوع واستبدال الماء بماء جديد.
يمكن استخدام الماء لسقي الأواني والنباتات.