تغطية شاملة

عملية طي البروتين

إن فهم الآلية التي تتحكم في طي البروتينات مهم ليس فقط للأبحاث البيولوجية الأساسية، بل قد يساعد أيضًا في دراسة الأمراض، نظرًا لأن العديد من الأمراض - بما في ذلك مرض الزهايمر - تتميز بسوء طي البروتينات. يعد تحليل آلية طي البروتينات الصغيرة أمرًا بسيطًا نسبيًا، نظرًا لأن الانتقال من الشكل غير المطوي إلى الشكل المطوي يتم في خطوة واحدة. ولكن ماذا عن البروتينات الكبيرة والمعقدة؟

الجالسون من اليمين: ريتا أوغست، البروفيسور جلعاد هاران، د.عنبال ريفان، مناحيم فرحي الواقفون من اليمين: ميلا جومانوفسكي، د.يوآف باراك، نير زوهار، شارونا زيديكاني كوهين. الخرز
الجالسون من اليمين: ريتا أوغست، البروفيسور جلعاد هاران، د.عنبال ريفان، مناحيم فرحي الواقفون من اليمين: ميلا جومانوفسكي، د.يوآف باراك، نير زوهار، شارونا زيديكاني كوهين. الخرز

البروتينات هي اللبنات الأساسية لعالم الحيوان. في الواقع، تعتمد جميع الأنشطة التي تحدث في الخلايا الحية على البروتينات: الحركة، والتنفس، ونشاط الجهاز المناعي والجهاز الهرموني، والنشاط الأنزيمي - هذه مجرد أمثلة قليلة على مجموعة واسعة من أنشطتها.

يبدأ البروتين حياته كسلسلة طويلة، مصنوعة من "خرزات" من الأحماض الأمينية. إن تسلسل الخرزات هو الذي يحدد البنية الأساسية للبروتين. ولكن، لكي يكتسب البروتين قدرته على النشاط، يجب أن "ينضج"، أي أن يتحول إلى بنية نشطة ثلاثية الأبعاد. يوفر الهيكل ثلاثي الأبعاد للبروتين رؤى مهمة حول نشاطه. ولهذا السبب، ظل العلماء لعقود من الزمن يطورون أدوات وطرق لفك رموز البنية ثلاثية الأبعاد للبروتينات.
لكن في بعض الأحيان تكون الطريقة - أو العملية - لا تقل أهمية عن النتيجة النهائية: كيف يتم الانتقال من الحالة الأولية للبروتين إلى البنية المطوية النهائية؟ إن فهم الآلية التي تتحكم في طي البروتينات مهم ليس فقط للأبحاث البيولوجية الأساسية، بل قد يساعد أيضًا في دراسة الأمراض، نظرًا لأن العديد من الأمراض - بما في ذلك مرض الزهايمر - تتميز بسوء طي البروتينات. يعد تحليل آلية طي البروتينات الصغيرة أمرًا بسيطًا نسبيًا، نظرًا لأن الانتقال من الشكل غير المطوي إلى الشكل المطوي يتم في خطوة واحدة. ولكن ماذا عن البروتينات الكبيرة والمعقدة؟

ويوضح أن تحليل آليات طي البروتينات الكبيرة يشبه إلى حد ما قراءة الخرائط البروفيسور جلعاد هارانمن قسم الفيزياء الكيميائية في كلية الكيمياء. "يمكنك التعرف على العديد من الطرق على الخريطة، والتي تؤدي جميعها إلى نفس النقطة. بعض هذه الطرق مستقيمة وبسيطة، والبعض الآخر يتعين عليه عبور الجبال والوديان للوصول إلى نفس الوجهة. نأمل من خلال رسم الخرائط معرفة ما إذا كانت البروتينات تستخدم عدة طرق - أو عدة أشكال هيكلية وسيطة - تؤدي إلى البنية المطوية النهائية. وإذا كان الأمر كذلك بالفعل، فكم عدد هذه الأشكال الوسيطة الموجودة؟ هل يتعين عليهم المرور بجميع النماذج الوسيطة، أم يمكنهم اتباع طرق مختصرة وتجاوز بعضها؟ هل لديهم طريق مفضل، أو تسلسل مختار من الأشكال؟ هل تؤثر الظروف الخارجية، مثل درجة الحرارة، على سلوكهم؟"

للإجابة على هذه الأسئلة طور البروفيسور هيرن طريقة بحث فريدة من نوعها. وقد اختار مع أعضاء فريقه - بما في ذلك طلاب البحث مناحيم فرحي، وشارونا سيدجاني كوهين، ونير زوهر، وطالب البحث السابق غي زيف، وباحث ما بعد الدكتوراه عنبال ريفان، والباحث يوآف باراك، من قسم البنى التحتية للبحوث الكيميائية - اختياره. بروتين معين (إنزيم أدينيلات كيناز)، وتم تمييزه بعلامات الفلورسنت عند نقطتين مختلفتين على طول سلسلة الأحماض الأمينية التي يتكون منها. عندما تكون العلامتان بعيدتين عن بعضهما البعض (أي عندما لا يكون البروتين مطويًا)، ينبعث الضوء الأخضر. عندما يطوي البروتين، تقترب العلامات من بعضها البعض، وينبعث الضوء الأحمر. وهكذا، من خلال مراقبة الضوء المنبعث، كان العلماء يأملون في رسم خريطة لموقع الأحماض الأمينية الموسومة، وبهذه الطريقة تحديد عدد الحالات الوسيطة المطلوبة للبروتين في الانتقال من الشكل غير المطوي إلى الشكل المطوي.
قبل الشروع في العمل، كان على العلماء أن يواجهوا مشكلة أخرى: جزيئات البروتين تهاجر بحرية، لذلك من الصعب متابعتها لفترة طويلة بما يكفي لتحليلها. للتغلب على المشكلة، أنشأ البروفيسور هاران نوعًا من الفخ: حيث تم وضع كل جزيء بروتين في حويصلة شفافة تم لصقها على سطح زجاجي. يمنع هذا الجهاز جزيئات البروتين من الحركة، وبالتالي يمكن إجراء القياسات. تم اكتشاف مشكلة أخرى مع علامات الألوان الفلورية، والتي فقدت لونها في غضون ثوانٍ قليلة - وهي فترة زمنية قصيرة جدًا لمتابعة عملية الطي بشكل كامل. لقد قام العلماء بحل المشكلة بطريقة تشبه محاولة عالم النفس فك رموز الحالة الذهنية الحالية للشخص من خلال تجميع أجزاء من الأحداث التي تظهر له بترتيب عشوائي: فقد استخدموا الآلاف من جزيئات البروتين، وقاموا بتحليل أجزاء قصيرة من عمليات الطي - كل منها يبدأ في نقطة زمنية مختلفة. ثم استخدموا التحليل الإحصائي الذي طوروه من أجل "لصق" التسلسلات القصيرة لأحداث الطي معًا، وفقًا للترتيب الزمني الصحيح.
الجالسون من اليمين: ريتا أوغست، البروفيسور جلعاد هاران، د.عنبال ريفان، مناحيم فرحي الواقفون من اليمين: ميلا جومانوفسكي، د.يوآف باراك، نير زوهار، شارونا زيديكاني كوهين. الخرز
الجالسون من اليمين: ريتا أوغست، البروفيسور جلعاد هاران، د.عنبال ريفان، مناحيم فرحي الواقفون من اليمين: ميلا جومانوفسكي، د.يوآف باراك، نير زوهار، شارونا زيديكاني كوهين. الخرز

أظهرت نتائج البحث، التي نُشرت مؤخرًا في مجلة Nature Communications، أنه بالنسبة للبروتين الذي اختبروه، هناك ستة أشكال وسيطة محتملة تؤدي إلى البنية النهائية ثلاثية الأبعاد. تعتمد الطريقة التي يتم بها اختيار البروتين للطي على عوامل خارجية، مثل درجة الحرارة أو التركيزات الكيميائية المختلفة. وهكذا، على سبيل المثال، كلما زاد تركيز مادة كيميائية معينة، كلما زاد ميل البروتين إلى اختيار مسار أطول وأكثر "مملة" - عندما يزور كل من الأشكال الستة الوسيطة، واحدًا تلو الآخر، قبل الوصول إلى البنية النهائية. . عند التركيزات المنخفضة من المادة، يختار البروتين مسارًا أقصر، يمكنه من خلاله استخدام اختصارات تحفظ بعض الأشكال الوسيطة، ولكنها لا تزال تقوده

إلى الهيكل النهائي الصحيح.
نظرًا لاحتمالات الطي العديدة لجزيئات البروتين، فإن فحص آلاف الجزيئات واحدًا تلو الآخر سمح للعلماء بتحديد آلية الطي الدقيقة - على عكس متوسط ​​النتيجة التي تم الحصول عليها من قياس جميع الجزيئات معًا. ويخطط العلماء لمواصلة دراسة جزيئات البروتين الأخرى، وبالتالي فحص ما إذا كانت القوانين التي اكتشفوها صالحة لجميع البروتينات، وفهم القوى التي توجه طي البروتينات بشكل أعمق.

تعليقات 3

  1. "يمكنك التعرف على العديد من الطرق على الخريطة، والتي تؤدي جميعها إلى نفس النقطة"
    لا يوجد شيء للإضافة.

ترك الرد

لن يتم نشر البريد الإلكتروني. الحقول الإلزامية مشار إليها *

يستخدم هذا الموقع Akismat لمنع الرسائل غير المرغوب فيها. انقر هنا لمعرفة كيفية معالجة بيانات الرد الخاصة بك.