في هذا المشروع، هناك تعاون بين شركة IBM وجامعة إدنبرة في استخدام الكمبيوتر العملاق Blue Gene للفحص المتزامن للقاحات الإيدز المختلفة
قام باحثون من مختبر أبحاث IBM في حيفا، بالتعاون مع مجموعة من المؤسسات العلمية والهيئات الصناعية من أوروبا، بتطوير نظام متكامل لإدارة علاج مرض الإيدز، يسمى EUResist.
ويجمع النظام بين قواعد البيانات الشاملة والتقنيات المتقدمة لتحليل البيانات والمعلومات، إلى جانب أدوات التنبؤ والنماذج الحاسوبية، من أجل التنبؤ بكيفية استجابة الطفرات الجينية لفيروس نقص المناعة البشرية للعلاجات المصممة لوقف تكاثر الفيروس. يمكن للأطباء الذين يعالجون حاملي ومرضى الإيدز استخدام نظام تم تطويره أيضًا من قبل الباحثين في مختبر الأبحاث في حيفا لاختيار الأدوية الأكثر فعالية، ومجموعات الأدوية المناسبة لكل مريض.
وأشار بوعز كرملي، مدير مجال الصحة وعلوم الحياة في مختبر أبحاث IBM في حيفا، إلى أن “مراقبة تاريخ العلاجات وتقدم الفيروس أمر ضروري لضمان نجاح العلاج. إن توفر المعرفة المبنية على كميات كبيرة من البيانات سيسمح للأطباء بمراعاة الخصائص الخاصة للمريض وطبيعة الفيروس وطفراته وحالة المرض في أي لحظة."
يجمع مشروع EUResist بين أكبر قواعد البيانات المُدارة في أوروبا في مجال الإيدز، ومعلومات حول الاستجابة للعلاجات المختلفة وفقًا للتحليل الجيني لملف المرضى والفيروس. تأتي معظم البيانات من قواعد البيانات في إيطاليا وألمانيا والسويد. ويتم إجراء البحث في حيفا ضمن البرنامج الإطاري السادس للمجتمع الأوروبي، ويضم أيضًا باحثين من معهد ماكس بلانك، والمستشفى الجامعي في كولونيا، وجمعية صناعة الأبحاث الصيدلانية الأوروبية EFPIA.
سيقوم كمبيوتر عملاق في اسكتلندا بتحليل لقاحات جديدة لمكافحة الإيدز
إن مكافحة الإيدز هي أيضًا الهدف الرئيسي لبرنامج بحثي مدته خمس سنوات، مشترك بين LibM وجامعة إدنبره الاسكتلندية، يهدف إلى تطوير لقاح ضد فيروس الإيدز، والذي سيمنع الفيروس من إصابة الخلايا البشرية. وكجزء من البحث، ستتعاون فرق من شركة IBM وجامعة إدنبرة: سيقدم فريق الجامعة خبرته في مجالات البحث التجريبي، في حين توفر شركة IBM للمشروع أقوى كمبيوتر خارق في العالم، "Blue Gene". وسيقوم الكمبيوتر بإجراء محاكاة لكيفية عمل اللقاحات المختلفة وقدرتها على اعتراض الفيروس وتدميره قبل أن يصيب خلايا الجسم.
ويهدف التعاون إلى تقليل مقدار الوقت اللازم للبحث على كل لقاح مقترح بشكل كبير - وتقليل عدد المتغيرات التي يجب اختبارها في إطار التجارب الطبية في المختبر وعلى البشر. الهدف النهائي الذي يواجه المشروع المشترك هو ضمان إجراء بحث أسرع وتطوير أسرع للقاح - على أمل التوصل إلى لقاح كامل ضد المرض في أقرب وقت ممكن.
وسيعمل الباحثون في جامعة إدنبرة على تطوير لقاحات تركز على مناطق مختلفة من الفيروس، وهي المسؤولة عن اختراق الحمل الجيني للفيروس إلى داخل الخلية البشرية. وسيتيح التعاون مع شركة IBM إمكانية تطوير عدد كبير من الأساليب ونقاط الحظر في وقت واحد - والتي ستمنع الفيروس من الخضوع لطفرة تسمح له بتجاوز العلاج الدوائي. النهج الجديد لتصميم الأدوية، القائم على قدرات الحوسبة والمعالجة لـ "الجين الأزرق"، يستخدم خوارزميات متطورة وأساليب تجريبية متقدمة، والتي ستمكن من تحسين الجزيئات المستخدمة لعلاج الناقلين والمرضى.
ويركز البحث على كيفية تواصل فيروس نقص المناعة البشرية (HIV-1) مع الخلايا الموجودة في جسم الإنسان، وحقن مادته الوراثية فيها. ويقوم العلماء بفحص قسم من البروتين الذي يشكل سطح الفيروس، والمعروف أيضًا باسم الببتيد، وهو عامل أساسي في تحفيز الاستجابة المناعية للجسم لهجوم الفيروس. إن فهم بنية وسلوك هذا الببتيد سيجعل من الممكن تصميم العديد من الأدوية في نفس الوقت، والتي ستكون قادرة على التركيز على عملية العدوى.
تم تصميم الكمبيوتر العملاق "Blue Gene" من IBM من الألف إلى الياء للتعامل مع هذا النوع من المشاكل الحسابية: محاكاة كيفية تطور سلاسل البروتين، والطفرات الفيروسية والتفاعل المحتمل للأدوية داخل جسم الإنسان. عندما تم إطلاق مشروع "الجين الأزرق" عام 1999، أراد المطورون تقديم طريقة جديدة تمامًا للتفكير ومفهوم جديد لبنية الحوسبة، مما يتيح حلولاً أسرع للمشكلات التي تتطلب معالجتها شهورًا وسنوات من الحساب المستمر في أنظمة الكمبيوتر التقليدية.
وتستخدم العشرات من الجامعات والهيئات الحكومية ومعامل الأبحاث والشركات الصناعية حاليًا أنظمة وخدمات شركة IBM في مجال الحوسبة الفائقة. وفي عام 2004، قامت جامعة إدنبرة بتركيب أول كمبيوتر "بلو جين" في أوروبا. يركز التعاون الحالي مع IBM على طرق التصوير على المستوى الذري، باستخدام أدوات برمجيات IBM المتقدمة التي تجعل من الممكن الاستفادة من قدرة الكمبيوتر العملاق BlueGene/L في المعالجة المتوازية على نطاق واسع - إلى جانب التقنيات التجريبية الدقيقة والمتقدمة، كل ذلك من أجل تحديد كيفية عمل الأحماض الأمينية والببتيدات، وهي اللبنات الأساسية لكل بروتين.
