سمح فك التسلسل الجينومي لفيروس كورونا في إسرائيل للباحثين بتتبع حركة الفيروس بدقة من الخارج إلى دولة إسرائيل ومن منطقة إلى أخرى داخل الدولة. * حددت الدراسة مجموعة من المرضى كان الجينوم لديهم متطابقًا بنسبة 100%. المعنى: جزء كبير من الوباء في إسرائيل هو نتيجة المرضى الذين ينشرون أولئك الذين ساهموا في العدوى الجماعية. * البيانات التي تم الحصول عليها من البحث يمكن أن تساعد بشكل كبير صناع القرار في قضايا مثل فرض الإغلاق وفتح الحدود وما إلى ذلك.
قام باحثون في جامعة تل أبيب، بقيادة الدكتور عدي شتيرن من قسم الأحياء الدقيقة الجزيئية والتكنولوجيا الحيوية في كلية علوم الحياة، بتسلسل جينوم فيروس كورونا لأول مرة كما يظهر في إسرائيل. وسمح التسلسل للباحثين بتحديد طفرات محددة تشير إلى سلاسل العدوى وطرق انتقال الفيروس من الخارج إلى إسرائيل ومن مكان إلى آخر داخل البلاد.
وشارك في الدراسة طلاب البحث دانيال ميلر، نوعام هاريل، تاليا كوستين، عمر تيروش وموران مئير من جامعة تل أبيب، بالإضافة إلى باحثين من جامعة إيموري في الولايات المتحدة الأمريكية، من معهد جارتنر في شيبا، من معهد حولون للتكنولوجيا. والمراكز الطبية شيبا، أسوتا أشدود، هداسا عين كارم، فوريا، سوروكا وبرزيلاي، بالإضافة إلى مركز الجينوم في التخنيون.
تعتمد الدراسة على تحليل تسلسل الجينوم لأكثر من 200 مريض في إسرائيل، وعلى التوزيع الجغرافي للمستشفيات في إسرائيل، والتي تشكل معًا عينة تمثيلية لجميع السكان في البلاد. وتم نشر الدراسة على موقع medRxiv لمشاركتها على الفور مع مجتمع البحث العالمي.
ويوضح الدكتور عدي شتيرن من قسم الأحياء الدقيقة الجزيئية والتكنولوجيا الحيوية في كلية علوم الحياة بجامعة تل أبيب، أن فيروس كورونا يتميز بكونه يتراكم الطفرات بشكل ثابت. هذه الطفرات لا تؤثر على الفيروس (أي أنه يبقى مستقرا ولا يتغير عنفوانه)، لكن هذه الطفرات تجعل من الممكن تتبع سلسلة العدوى من بلد إلى آخر. على سبيل المثال، في بداية الوباء في الصين، تمت إضافة طفرة واحدة إلى اثنتين. وقد هاجر فيروس يحمل إحدى هذه الطفرات إلى أوروبا وتراكمت فيه المزيد من الطفرات، ومن هناك إلى الولايات المتحدة الأمريكية، وهكذا. ولذلك، فإن الطفرات هي نوع من الباركود الذي يسمح بالتتبع من بلد إلى آخر.
وفي إطار الدراسة، قارن الباحثون التسلسل الجينومي الموجود بين المرضى في إسرائيل بـ 4,700 تسلسل جينومي من دول مختلفة في العالم، وهكذا تم الحصول على الصورة الكاملة لـ "سلسلة العدوى داخل إسرائيل وداخلها".
كما ذكرنا، تظهر الدراسة أن أكثر من 70% من المرضى في إسرائيل أصيبوا بفيروس نشأ في الولايات المتحدة، أي حاملين للعدوى أصيبوا في الولايات المتحدة "وأحضروا" الفيروس معهم إلى إسرائيل. كما ينتمي ما يقرب من 30% من المرضى إلى "سلاسل العدوى" الناشئة في الدول الأوروبية: بلجيكا (حوالي 8%)، فرنسا (حوالي 6%)، إنجلترا (حوالي 5%)، إسبانيا (حوالي 3%)، إيطاليا (حوالي 2%). حوالي 2%))، أستراليا (حوالي 2%)، الفلبين (حوالي 2%)، روسيا (حوالي XNUMX%). تجدر الإشارة إلى أنه على الرغم من أن جميع تسلسلات الجينوم تحدد الصين كنقطة انطلاق، إلا أنه لا توجد إصابات تقريبًا في إسرائيل مصدرها الصين أو دول آسيوية أخرى.
ويضيف الدكتور ستيرن: "يتعامل مختبري مع تطور الفيروسات وجينومياتها، ومن بين أشياء أخرى نستخدم تقنية تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA/DNA). عندما تفشى وباء كورونا، حشدنا جهودنا، مثل العلماء في جميع أنحاء العالم، لدراسة الفيروس المسبب له. تشير النتائج التي توصلنا إليها بوضوح إلى أن معظم سلاسل العدوى تأتي من الولايات المتحدة الأمريكية والدول الأوروبية. ومن وجهة نظر استشرافية، من الممكن في المستقبل أن يتم إغلاق أبواب البلاد في وقت مبكر مع تفشي وباء عالمي، وبالتالي تقليل احتمالات دخول الفيروس إلى إسرائيل بشكل كبير".
حركة فيروس كورونا داخل دولة إسرائيل
بالإضافة إلى ذلك، يوفر تسلسل الجينوم بيانات دقيقة وموضوعية فيما يتعلق بهجرة فيروس كورونا داخل دولة إسرائيل. ومن خلال القيام بذلك، فهو يضيف طبقة مهمة إلى التحقيق الوبائي الذي كان حتى الآن يعتمد على استجواب شخصي لحاملي الفيروس والمرضى - أين كانوا ومن اتصلوا بهم.
هذه هي الطريقة التي يمكن بها توليد الكثير من المعلومات الوبائية الأساسية بمختلف أنواعها:
- اكتشف معدلات الإصابة في بيئات مختلفة - في الأسرة، في المبنى، في المدرسة، في الحي، إلخ.
- اكتشف العوامل شديدة العدوى في مرحلة مبكرة - الناقلون الذين، لأسباب مختلفة، يسافرون من مدينة إلى أخرى ويصيبون العديد من الأشخاص. على سبيل المثال، تم اكتشاف فيروسات متطابقة في عينات من مرضى في أماكن متباعدة، مثل طبريا والقدس - وهو ما يشير على ما يبدو إلى حامل للفيروس سافر من مدينة إلى أخرى. هذه الاكتشافات مهمة لفهم كيفية انتشار الفيروس في إسرائيل.
- تحديد الأحداث التي أدت إلى عدوى جماعية ومنع وقوع أحداث مماثلة في المستقبل. على سبيل المثال، حددت الدراسة مجموعة من المرضى الذين كانت جينوماتهم متطابقة بنسبة 100%، وأحد الشكوك المحتملة هو أن هذا يرجع إلى كون المرضى "ناشرين فائقين" للفيروس والذين ساهموا في انتشار العدوى الجماعية. نقوم الآن بدمج هذه المعلومات مع المعلومات المستمدة من التحقيقات الوبائية لتحديد مكان تواجد هؤلاء المرضى.
- بهذه الطرق وغيرها، يمكن للبيانات الدقيقة التي تم الحصول عليها من تسلسل الجينوم أن تكون بمثابة أساس مهم للغاية لاتخاذ قرارات صحيحة وعالية الجودة فيما يتعلق بالأسئلة التي تشغلنا طوال هذه الأيام: متى وأين نفرض الإغلاق؟ متى يمكن فتح الأسواق / المولات / رياض الأطفال؟ كيف يمكن منع الموجة التالية إذا جاءت؟ و اكثر.
النموذج الرياضي الإحصائي لتقدير عدد المرضى
جانب آخر من البحث هو تطوير نموذج إحصائي رياضي معقد يعتمد على تسلسل الجينوم لتقييم البيانات الوبائية من الوباء. أولاً، يوضح النموذج أن معدل الإصابة بالفيروس (أي عدد المرضى الذين أصابهم كل مريض) انخفض بشكل ملحوظ بعد الإغلاق. ثانيًا، أظهر النموذج أن هناك تباينًا كبيرًا بين المرضى في عدد الأشخاص الذين ينقلهم كل مريض إليهم. وفي نهاية المطاف، يقدر النموذج أن أكثر من 80% من حالات العدوى تنشأ من حوالي 10% فقط من المرضى أو أقل. وهذا يعني أن معظم الإصابات في إسرائيل حدثت بسبب "ناشري العدوى الفائقين". أخيرًا، اعتبارًا من اليوم، استنادًا إلى النموذج والخطة الأرضية، يمكن تقدير أن ما لا يزيد عن 1٪ من السكان في إسرائيل أصيبوا بالفيروس، مما يعني أن إسرائيل بعيدة جدًا عن مناعة القطيع.
وفي الختام يقول الدكتور شتيرن: "في بحثنا، أجرينا لأول مرة تسلسلًا جينيًا ضخمًا لفيروس كورونا في إسرائيل. وتحظى هذه التكنولوجيا والمعلومات التي تقدمها بأهمية كبيرة لفهم الفيروس وكيفية انتشاره بين السكان، كأساس علمي وموضوعي لعمليات صنع القرار على المستوى المحلي والوطني. يمكن للبيانات التي تم الحصول عليها من البحث أن تساعد صانعي القرار بشكل كبير في قضايا مثل فرض الإغلاق، وإغلاق الحدود، وتحديد موقع الأشخاص المصابين بالعدوى الفائقة وعزلهم، وما إلى ذلك. بهذه الطريقة، يقدم البحث مساهمة كبيرة في التعامل مع وباء الكورونا في إسرائيل، والأكثر من ذلك: قمنا في هذا البحث بتطوير أدوات تسمح لنا بالتعامل بشكل أفضل، في الوقت الفعلي، مع التفشي التالي لفيروس الكورونا و/ أو مع أي وباء آخر قد يظهر."
المزيد عن الموضوع على موقع العلوم:
- على خلفية انتشار فيروس كورونا: ما هو "الموزع الفائق"؟ يوضح اختصاصي الأمراض المعدية
- وفي إسرائيل نجحوا في خفض عدد الوفيات بسبب كورونا مقارنة بالصين وإيطاليا اللتين كانت أنظمتهما الصحية مشبعة
- وطور باحثون من جامعة تل أبيب اختبارا مصليا للكشف عن الأجسام المضادة لكورونا وسيستخدمونه لاختبار جنود جيش الدفاع الإسرائيلي
تعليقات 5
أبحاث الجينوم: 90% من حالات العدوى تأتي من المتدينين. إذا كانت هذه حقيقة إحصائية، فهذه ليست عنصرية
لسبب ما، يتجنب الجميع قول ما هو واضح للغاية: خلال الفترة التي كان من المفترض أن تكون السماء مغلقة فيها، استمر ساتمار المرضى في الوصول إلى هنا بأمر من ريبي. إنها حقيقة أن 70% من الإصابات تنشأ في الولايات المتحدة، بالإضافة إلى أننا نعلم بالفعل أن المشرفين على الشريعة اليهودية ينشرون الفيروس في جميع أنحاء البلاد، وأن بني براك كانت أيضًا مركز العدوى. لماذا يخافون من قول ما يعرفه الباحثون وتعكس النتائج: اليهود المتطرفون هم المسؤولون عن معظم الأمراض في بلادنا، تم حذف أسمائهم من تعليمات الحجر الصحي، واستمر وصول المرضى، وانتشروا من خلال آلية تسمى "كشروت" على سبيل المثال للقرى العربية. لقد رأينا جميعًا الجنازات الجماعية في نيويورك، أثناء الإغلاق، ورأينا الحاخام الغبي يقول لمواصلة الصلاة معًا في المدرسة الدينية على الرغم من الوباء. إذا كان هناك أي شيء مما كتبته غير صحيح - أحضر بيانات متضاربة، لأن كل شيء موثق بشكل عكسي. أنا يهودي أيضًا، لذلك لا يمكنك القول إنني معاد للسامية، لكن يمكنك القول إن الأرثوذكس المتطرفين كانوا بالتأكيد منشئي/مسرعي انتشار الوباء.
آسف !
ولكن يجب حذف تعليق داني.
إنها لا علاقة لها بالموضوع على الإطلاق، فهي عنصرية ومعادية للسامية.
لا تدع الموقع ينزل إلى صحيفة شعبية رخيصة
ومن الواضح أيضًا من أي قطاع جاء مرضى كورونا من الولايات المتحدة وفي أي الأماكن حدثت تلك الإصابات الجماعية.
كما أنني أفهم قلوب محرري الدراسة الذين تجنبوا الكشف عن هذه المعلومات في ظل المناخ السياسي والثقافي الذي تعيشه إسرائيل اليوم.
رفرف إلى ليتسمان.
باختصار - كان بيبي فخورًا بأنه أغلق أبواب السماء أمام القادمين من الصين وإيطاليا، لكنه تردد كثيرًا فيما إذا كان سيغلق من الولايات المتحدة أيضًا واستغرق الأمر أيامًا عديدة ليقرر في النهاية أن ذلك مستحيل. لإغلاق الولايات المتحدة وترك دول أخرى في العالم أكثر نظافة، لذلك أغلق الدخول عن بقية العالم.
لو أنه أغلق الولايات المتحدة بمجرد علمه بقوة الوباء هناك - لكان قد أنقذ الكثير من الأرواح ولم تكن هناك حاجة أيضًا للإغلاق الكامل الذي فُرض على البلاد بأكملها وأدى إلى انهيار العديد من الشركات. ودمروا الاقتصاد.
لذلك يستمر في نيل الفضل على الخطوات الجيدة التي اتخذها (وهو يستحق ذلك)، لكنه ليس قريباً ويتحمل مسؤولية أخطائه - وهذا أكبرها.