باحثون من جنوب أفريقيا يشرحون كيف تم العثور على نسخة أوميكرون الجديدة وما نعرفه حتى الآن

يتطلب البحث عن المتغيرات جهدًا مركَّزًا. كانت جنوب أفريقيا والمملكة المتحدة أول الدول الكبرى التي نفذت جهود المراقبة الجينومية الوطنية لـ SARS-CoV-2 في وقت مبكر من أبريل 2020. ويقوم العلماء في جنوب أفريقيا بتسلسل الفيروس ودراسة خطورته

بقلم: البروفيسور فولفغانغ فريزر، رئيس قسم علم الفيروسات الطبية، جامعة ستيلينبوش; كاثرين شيبرز، عالمة طبية أولى، جامعة ويتواترسراند;  جينال بيمان، كبير علماء الطب في المعهد الوطني للأمراض المعدية (NICD)؛ ماريتي فينتر, برنامج الفيروسات الحيوانية المنشأ والفيروسات التنفسية، أستاذ في قسم علم الفيروسات الطبية، جامعة بريتوريا;  توليو دي أوليفيرا يقود منصة KRISP – كوازولو ناتال للبحث والابتكار، جامعة كوازولو ناتال

منذ بداية وباء كورونا، قامت شبكة المراقبة الجينية في جنوب أفريقيا برصد التغيرات في فيروس SARS-CoV-2. وكانت هذه أداة قيمة لفهم كيفية انتشار الفيروس بشكل أفضل. وفي نهاية عام 2020، حددت الشبكة سلالة فيروس جديدة، 501Y.V2، والتي أصبحت تعرف فيما بعد باسم النسخة التجريبية. والآن تم التعرف على نسخة جديدة من SARS-CoV-2 - B.1.1.529. وقد أعلنت منظمة الصحة العالمية أنه مثير للقلق، وأعطته اسم أوميكرون. لمساعدتنا على فهم المزيد، المحادثة طلبت جنوب أفريقيا من العلماء مشاركة ما يعرفونه.

ما هو العلم وراء البحث؟

يتطلب البحث عن المتغيرات جهدًا مركَّزًا. كانت جنوب أفريقيا والمملكة المتحدة أول الدول الكبرى التي نفذت جهود المراقبة الجينومية الوطنية السارس COV-2 بالفعل في أبريل 2020.

إن صيد المتغيرات، بقدر ما يبدو مثيرًا، يتم عن طريق تسلسل الجينوم الكامل للعينات التي ثبتت إصابتها بالفيروس. تتضمن هذه العملية التحقق من كل تسلسل تم استلامه وإيجاد الاختلافات مقارنة بما نعرفه منتشرًا في جنوب إفريقيا والعالم. عندما نرى اختلافات متعددة، فإن هذا يثير على الفور علامة حمراء ونقوم بالتحقيق أكثر لتأكيد فرضياتنا.

ومن حسن الحظ أن جنوب أفريقيا مستعدة جيداً لهذا الأمر. وذلك بفضل قاعدة البيانات المركزية لنتائج المختبرات في القطاع العام في خدمة المختبرات الصحية الوطنية (NGS-SA)وروابط جيدة للمختبرات الخاصة ومركز المعلومات الصحية في ويسترن كيب وخبرة متقدمة في أخذ العينات.

بالإضافة إلى ذلك، يوجد في جنوب إفريقيا عدد من المختبرات التي يمكنها زراعة الفيروس ودراسته عمليًا ومعرفة مدى قدرة الأجسام المضادة، التي تم إنشاؤها استجابة للتطعيم أو المرض السابق، على تحييد الفيروس الجديد. ستسمح لنا هذه البيانات بتوصيف الفيروس الجديد.

تنتشر النسخة التجريبية بشكل أكثر كفاءة بين الأشخاص مقارنة بالنسخة البرية أو "الفيروسات الأولية". السارس COV-2 وتسبب في الموجة الوبائية الثانية في جنوب أفريقيا. ولذلك يتم تصنيفها على أنها متغير القلق. خلال عام 2021، انتشر متغير آخر يسبب القلق يسمى دلتا في جميع أنحاء العالم تقريبًا، بما في ذلك جنوب إفريقيا، حيث تسبب في موجة وبائية ثالثة.

تم اكتشافه مؤخرًا في التسلسل الروتيني بواسطة مختبرات أصدقائي شبكة مراقبة الجينوم سلالة فيروس جديدة تسمى ب 1.1.529 ، فى جنوب افريقيا. وتم اكتشافه في 77 عينة تم جمعها في منتصف نوفمبر 2021 في مقاطعة غوتنغ. كما تم الإبلاغ عن ذلك بأعداد صغيرة من بوتسوانا المجاورة وكذلك هونج كونج. وبحسب التقارير فإن الشخص المصاب الذي تم العثور عليه في هونغ كونغ هو مسافر من جنوب أفريقيا.

منحت منظمة الصحة العالمية ب 1.1.529 انت هناك أوميكرون وصنفتها على أنها نسخة من القلق، مثل بيتا ودلتا.

ومن المحتمل أن مرضى الإيدز كانوا الحاضنة لطفرات فيروس كورونا

لماذا يتم اكتشاف المتغيرات التي تسبب القلق في جنوب أفريقيا؟

لا نعرف على وجه اليقين. ومن المؤكد أن الأمر يبدو أكثر من مجرد نتيجة للجهود المتضافرة لمراقبة الفيروس المنتشر. إحدى النظريات هي أن الأشخاص الذين يعانون من ضعف شديد في أجهزة المناعة، والذين يعانون من عدوى نشطة لفترة طويلة لأنهم لا يستطيعون التخلص من الفيروس، قد يكونون مصدرًا للمتغيرات الفيروسية الجديدة.

من المفترض أن قدرًا معينًا من "الضغط المناعي" (أي استجابة مناعية ليست قوية بما يكفي للقضاء على الفيروس ولكنها تمارس قدرًا معينًا من الضغط الانتقائي الذي "يجبر" الفيروس على التطور) يخلق الظروف الملائمة لظهور الفيروس. المتغيرات الجديدة.

على الرغم من وجود برنامج علاجي متقدم بمضادات الفيروسات القهقرية للأشخاص المصابين فيروس نقص المناعة البشريةيعاني العديد من الأشخاص في جنوب إفريقيا من مرض ما فيروس نقص المناعة البشرية تقدمية ولا يتم علاجها بالعلاج الفعال. وقد تمت دراسة العديد من الحالات السريرية لدعم هذه الفرضية، ولكن لا يزال هناك الكثير لنتعلمه.

لماذا هذا الإصدار مثير للقلق؟

الجواب القصير هو أننا لا نعرف. الجواب الطويل هو، ب 1.1.529 يحمل طفرات معينة مثيرة للقلق. ولم يتم رؤيتها في هذا المزيج من قبل، ويحتوي بروتين سبايك وحده على أكثر من 30 طفرة. وهذا أمر مهم، لأن بروتين سبايك هو البروتين الذي يتكون منه معظم اللقاحات والذي من المفترض أن يتعرف عليه الجسم ويصنع أجسامًا مضادة ضده.

يمكننا أن نقول ذلك أيضاب 1.1.529 لديه ملف تعريف وراثي مختلف تمامًا عن المتغيرات الأخرى في دورة الاهتمام والقلق. ولا يبدو أنه "ابن دلتا" أو "حفيد بيتا" ولكنه يمثل سلالة جديدة من السارس COV-2.

بعض التغيرات الجينية في B معروفة من متغيرات أخرى ونعلم أنها يمكن أن تؤثر على انتقال العدوى أو تسمح بالتهرب من اللقاح، لكن الكثير منها جديد ولم تتم دراستها بعد. وبينما يمكننا تقديم بعض التنبؤات، إلا أننا لا نزال نحقق في مدى تأثير الطفرات على سلوكها.

نريد أن نعرف مدى العدوى وشدة المرض وقدرة الفيروس على "الهروب" من الاستجابة المناعية لدى الأشخاص الملقحين أو المتعافين. نحن نتعلم ذلك بطريقتين.

أولاً، نقوم بإجراء دراسات وبائية دقيقة لمعرفة ما إذا كانت السلالة الجديدة تظهر تغيرات في معدل الانتشار، وفي القدرة على نقل العدوى إلى الأشخاص الملقحين أو المصابين سابقاً، وما إلى ذلك.

وفي الوقت نفسه، تقوم الدراسات المخبرية باختبار خصائص الفيروس. تتم مقارنة خصائص نموه الفيروسي مع خصائص المتغيرات الأخرى للفيروس ويتم تحديد إلى أي مدى يمكن تحييد الفيروس بواسطة الأجسام المضادة الموجودة في دم الأفراد الملقحين أو المتعافين.

في نهاية المطاف، الأهمية الكاملة للتغيرات الجينية التي لوحظت فيب 1.1.529 وسيصبح واضحًا عندما تأتي نتائج كل هذه الأنواع المختلفة من الدراسات. إنها مهمة معقدة ومتطلبة ومكلفة وستستغرق أشهرا، ولكنها ضرورية لفهم الفيروس بشكل أفضل واستنباط أفضل الاستراتيجيات لمكافحته.

هل هناك مؤشرات مبكرة على أن هذا المتغير يسبب أعراضًا مختلفة أو مرضًا أكثر خطورة؟

لا يوجد دليل حتى الآن على وجود أي اختلافات سريرية. وما هو معروف هو أن عدد حالات الإصابة ب 1.1.529 وينمو الفيروس بسرعة في غوتنغ، حيث يبدو أن الموجة الرابعة من الوباء في البلاد قد بدأت. لا يمكننا أن نقول حقا بعد ما إذا كان ب 1.1.529 يتم تقديمه بكفاءة أكبر من الإصدار الشائع من دلتا.

أكثر احتمالا لكوفيد-19 في نسخة أوميكرون، سوف يظهر كمرض خطير، غالبًا ما يهدد الحياة، لدى كبار السن والمصابين بأمراض مزمنة. لكن المجموعات السكانية التي غالبًا ما تتعرض لأول مرة لفيروس جديد هي الأشخاص الأصغر سنًا والمتنقلين والأصحاء بشكل عام. إذا انتشر عقار أوميكرون بشكل أكبر، فسوف يستغرق الأمر وقتًا قبل أن يتم تقييم آثاره، من حيث شدة المرض.

ولحسن الحظ، يبدو أن جميع الاختبارات التشخيصية التي أجريت حتى الآن قادرة على اكتشاف الفيروس الجديد.

والأفضل من ذلك أن بعض الاختبارات التجارية المستخدمة على نطاق واسع تظهر نمطًا محددًا: اثنان من تسلسلات الجينوم الثلاثة إيجابيان، لكن الثالث ليس كذلك. يبدو الأمر كما لو أن الإصدار الجديد يستجيب باستمرار لمربعين من أصل ثلاثة في الاختبار الحالي. يمكن استخدام هذا كعلامة لـ Omicron، مما يعني أنه يمكننا تقدير معدل الحالات الإيجابية بسرعة بسبب تلوث Omicron يوميًا ولكل منطقة. وهذا مفيد جدًا لرصد انتشار الفيروس في الوقت الفعلي تقريبًا.

هل من المحتمل أن تحمي اللقاحات الحالية من النسخة الجديدة؟

مرة أخرى، نحن لا نعرف. وتشمل الحالات المعروفة الأشخاص الذين تم تطعيمهم. ومع ذلك، فقد تعلمنا أن الحماية المناعية التي يوفرها اللقاح تتضاءل بمرور الوقت ولا تحمي من العدوى بقدر ما تحمي من المرض الخطير والوفاة. أحد التحليلات الوبائية التي بدأت هو النظر في عدد الأشخاص الذين تم تطعيمهم والذين أصيبوا بـ Omicron.

إن احتمال تهرب أوميكرون من الاستجابة المناعية أمر مثير للقلق. والتوقع المأمول هو أن توفر معدلات التطعيم والتعافي درجة من "المناعة الطبيعية" لفترة معينة على الأقل.

في نهاية المطاف، كل ما هو معروف عن أوميكرون حتى الآن يؤكد أن اللقاح الشامل لا يزال أفضل رهان لدينا ضد حالات كوفيد-19 الشديدة، وسيساعد، إلى جانب التدخلات غير الدوائية، نظام الرعاية الصحية على التكيف خلال الموجة التالية.

إلى مامr على موقع المحادثة

المزيد عن الموضوع على موقع العلوم:

• تسمح التكنولوجيا الجديدة بإلقاء نظرة خاطفة على ما يحدث داخل الخلايا
• يدعم الأمريكيون العلم، لكن الكثير منهم يعتقدون أن علم التنجيم هو علم
• ثلاثية الكورونا