بالفعل خلال البحث، تم اكتشاف مئات البروتينات الجديدة
آفي بيليزوفسكي
الرابط المباشر لهذه الصفحة: https://www.hayadan.org.il/compugen281004.html
أعلنت شركة كومبيوجن وجامعة تل أبيب اليوم عن تطوير مشترك لطريقة جديدة للتنبؤ بالظاهرة البيولوجية المهمة التي تسمى الربط البديل. بالفعل خلال البحث، تم اكتشاف مئات البروتينات الجديدة التي هي الآن في المراحل الأولية من التقييم والاختبار لإضافتها المحتملة إلى قاعدة بيانات الشركة للبروتينات العلاجية والتشخيصية. الدراسة المنشورة في مجلة Genome Research هي نتيجة تعاون بين علماء كومبيوجن والأساتذة رون شامير وجيل إست من جامعة تل أبيب.
تعتمد الطريقة الجديدة التي تم الإعلان عنها اليوم على خوارزميات تعلم الكمبيوتر التي تعكس فهم Compugen العميق لعمليات الربط البديلة. تعتمد الطريقتان المقبولتان حاليًا لتحديد الربط البديل على تحليل البيانات التجريبية المخبرية لـ ESTs (علامات التسلسل المعبر عنها) أو نتائج التجارب على رقائق الحمض النووي (المصفوفات الدقيقة). تعتمد هذه الطرق على عينة فقط من الربط البديل الموجود في الجينوم، وبالتالي فهي غير قادرة على التنبؤ بجزء كبير من مجموعة البروتينات المتنوعة التي يتم إنشاؤها بواسطة الربط البديل. في المقابل، فإن الطريقة المطورة حديثًا، المستندة إلى علم الجينوم المقارن، يمكنها التنبؤ بدقة بالربط البديل استنادًا فقط إلى المقارنة بين الحمض النووي البشري والفأر.
باستخدام النموذج الذي طوره علماء CompuGen بالتعاون مع البروفيسور شامير فاست، تم التنبؤ بأكثر من ثلاثمائة نوع جديد من الوصلات حتى الآن. وكل هذا في التطبيق الأولي لنموذج التعلم المحوسب. ومن المتوقع اكتشاف مئات المتغيرات الجديدة في التطبيقات المستقبلية للنموذج.
"يعد هذا التطور مثالًا آخر على البحث الفريد الذي تم إجراؤه في Compugen والذي يجمع بين نماذج التنبؤ والتنبؤ الفريدة مع التجارب المعملية، بدلاً من الطرق التجريبية التقليدية. لقد أدى استخدام نموذج الربط البديل بالفعل إلى زيادة مجموعة البروتينات ذات الإمكانات للتطبيقات العلاجية والتشخيصية بما يتجاوز ما كان ممكنًا باستخدام نظام LEADS الخاص بشركة Compugen استنادًا إلى بيانات ESTs،" كما يقول مور أميتاي، رئيس شركة Compugen. "وهكذا، نتوقع أن هذا الاكتشاف سيسمح لنا عمليًا بتضييق الفجوة المعرفية بين الجينوم البشري وجميع البروتينات البشرية من خلال تزويدنا بصورة أكثر اكتمالًا لمتغيرات الوصلات الموجودة. "
ويضيف أميتاي أن هذا الاكتشاف، إلى جانب الفهم المحسن للظواهر البيولوجية المهمة الأخرى، يسمح لشركة Compugen بمواصلة تحسين المنصة الحسابية ومحركات الاكتشاف التي تزود الشركة بالأساس لاكتشاف المنتجات التشخيصية والعلاجية.
يقول يتسحاق كولبيرج، رئيس شركة راموت ليد تل أبيب المحدودة، شركة تنفيذ التقنيات التي تم تطويرها في الجامعة: "هذا التطور الرائع هو نتيجة لمشروع بحث مشترك بين جامعة تل أبيب وشركة كومبيوجن". "هذا مثال على التعاون الفريد بين الجامعة والصناعة والذي يفيد الأبحاث الأساسية التي يتم إجراؤها في الجامعة وكذلك الأبحاث التطبيقية التي يتم إجراؤها في الصناعة وسيؤدي في النهاية إلى إطالة عمر وتحسين صحة المرضى في جميع أنحاء العالم. "
https://www.hayadan.org.il/BuildaGate4/general2/data_card.php?Cat=~~~988144783~~~227&SiteName=hayadan
